（一）完善体系建设和工作机制，监管效果得到提升
十二五”期间，基本组建了由自治区、7地（市）和74个县分局构成的三级食品药品监管体系框架。在自治区药品检验所的基础上建立了自治区食品药品检验所（自治区医疗器械检测中心），组建了6个地（市）食品药品检验所和自治区药品不良反应监测中心、自治区藏药审评认证中心，技术监督体系基本建立。整合自治区食安办、食品药品监管、工商行政、质监、商务部门涉及食品安全监管和药品管理职能，新组建的自治区食品药品监督管理局（正厅级）为自治区人民政府直属机构，对食品药品实行统一监管。各地（市）、县食品药品监管部门目前正在开展食品药品机构体制改革工作。农牧区药品监督网络建设不断加强，覆盖面不断扩展。
自治区人民政府在“十二五”期间印发了自治区食品药品监督管理局“三定规定”，有效推动了食品药品监管体制改革平稳有序进行与食品药品监管工作机制不断完善。坚持以技术支撑为手段，促进行政监管，实现了受理、检查、审批“三分离”并有效运转。大力推进行政审批制度改革，严把食品药品准入关，完善市场退出机制，调整和下放行政审批权限到达60%。制定了多项质量管理体系文件，药品审评、认证等工作趋于标准化。加大检验检测力度，自治区食品药品检验所申请扩项达16项。
制度建设不断加强，政府投入和援藏力度不断加大，7地（市）食品药品监管机构部分基础设施建设基本完成，行政监督执法装备水平和技术支撑能力得到提高，监管基础条件有所改善。监管队伍不断壮大，整体素质有所提高，行政审批制度改革不断推进，行政执法责任制进一步落实，依法行政水平不断提高，监管效能明显提升。
（二）食品药品安全保障水平进一步提高
全区各级政府建立了食品药品安全协调机构，食品药品安全责任进一步落实。食品安全综合协调能力不断加强，药品研制、生产、流通、使用各环节监管持续强化，国家基本药物质量监管有序开展，药品生产质量受权人制度稳步推行，国家基本药物电子监管网基本建立。药品不良反应、医疗器械不良事件和药物滥用监测不断加强，食品药品抽验和高风险品种监测力度不断加大，食品药品风险监测预警和突发事件应对能力不断提高，食品药品安全事件得到妥善处置。食品药品安全专项整治取得成效，制售有毒有害食品和假劣药品违法行为得到有效遏制，食物中毒和食源性疾病的防控能力不断提升。通过开展国家级食品安全示范县和自治区级食品安全示范县创建工作，以点带面，积极引导农牧民群众改变不良饮食习惯，改进农牧区食品安全状况，减少食物中毒事件和食源性疾病的发生。
食品安全监督抽检和风险监测逐步开展，从源头预防和控制食品安全，有效降低了食品风险转化成食品危害事件的机率。通过开展农牧区食品市场专项整治，食品市场经营主体准入资格不断规范，假劣食品生产流通得到有效遏制，农牧区食品市场环境趋于繁荣和稳定。“十二五”期间餐饮服务食品安全监管力度得到进一步增强，通过深入推进餐饮服务单位量化分级管理，全区量化单位达到95%以上；全面排查食品安全隐患，加强了各大节日期间的餐饮服务食品安全监督检查，保障了公众饮食安全。
药品安全专项治理取得成效。全区各级食品药品监管部门按照要求组织力量每年至少开展一次拉网式排查，对查出的问题药品采取下架、封存、销毁等管控措施，有效防止药品安全事件发生，保障了公众用药安全。医疗器械虚假注册、违规生产、非法经营、夸大宣传、无证使用“五整治”专项治理行动取得实效。
（三）基础设施及技术支撑体系建设逐步加强
随着自治区药品检验所更名为自治区食品药品检验所，承接了食品生产、流通、餐饮环节的检验检测任务，相继开展了食品、药品、医疗器械、化妆品、保健食品检验检测工作。在重大假冒伪劣药品查处案件中，自治区食品药品检验所及时完成了检验任务，为食品药品监管部门依法查处假冒伪劣药品提供了可靠的科学依据。自治区、7（地）市食品药品检验所配备了部分食品药品检测仪器及快速检测设备，极大提高了各地（市）食品药品监管局对农牧区药品抽验力度。总局协调财政部五年内累计落实中央转移支付资金2亿元，用于开展食品药品日常监管、专项整治、风险监测等，改善检测手段及配备执法装备，建立了12331投诉举报系统和食品抽检二级站的建设工作；投资350余万元，落实网络中心机房、门户网站建设项目；各对口支援省市向我区各地（市）局援助资金3230万元，有效改善了我区食品药品监管系统基础条件。“十二五”期间，经国家食药总局争取为我区投资39218万元的中央预算内资金，包括6500万元的食品药品基础设施建设项目和32718元的全区食品安全检测能力建设项目，已到位资金28076万元，完成了自治区食品药品检验所改扩建项目建设，自治区、7地（市）食品检验楼和仪器设备项目可研批复率100%，其中日喀则、昌都、林芝、山南、那曲、阿里等6地（市）项目均已开工，开工率为75%。通过落实有关项目，使全区食品药品检验检测能力得到了进一步提升。
（四）监管制度不断完善，食药经济健康发展
十二五”期间，药品注册工作取得突破性进展，全区现有311个国家药品批准文号，502个品种收载于《西藏基本用药目录》，298个藏医医疗机构制剂品种获得1031个医院制剂注册批准文号。藏药材标准修订和提高工作启动，《藏药材炮制规范》（藏文版）颁布实施，建立了102个地方药材标准。藏药研发能力不断提升，2家医疗机构获得国家药物临床试验机构资格认定证书。一是企业生产经营管理水平明显提高，大力推行新版GMP、GSP认证，全区23家药品生产企业均通过新版GMP认证，80家药品批发企业、357家药品零售企业通过新版GSP认证，2家医疗器械生产企业和192家医疗器械经营企业取得生产经营许可。二是规范标准制度，制定了《保健食品化妆品生产企业现场检查验收标准》，加强对保健食品、化妆品生产企业监管。出台了小型医用吸氧器监管制度，规范了市场秩序。三是规范质量标准。评定餐饮服务单位10027家，其中优秀等级504家，良好等级5019家，一般等级4504家。